6-Fluoro-4-methylquinoline ถูกนำไปใช้ในหลายด้านของงานวิจัยและอุตสาหกรรมเคมี โดยเฉพาะในด้านการพัฒนายาและสารเคมีที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้าง quinoline ที่มีฟลูออรีนและหมู่เมทิล ทำให้สารนี้มีศักยภาพในการเป็นสารตั้งต้นสำหรับสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางยา เช่น ยาต้านเชื้อแบคทีเรีย ยาต้านมะเร็ง หรือยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาท นอกจากนี้ ยังอาจถูกใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและกลไกการออกฤทธิ์ของสารในระดับโมเลกุล เพื่อพัฒนายาใหม่ที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและมีผลข้างเคียงน้อยลง