6-Bromo-4-fluoroquinoline ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาต่าง ๆ โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านแบคทีเรียและยาต้านไวรัส โครงสร้างของมันมีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างสารประกอบที่เล็งเป้าไปยัง DNA gyrase และ topoisomerase IV ของแบคทีเรีย ทำให้มีประโยชน์ในการรักษาการติดเชื้อ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการออกแบบโมเลกุลที่มีศักยภาพในการต้านมะเร็ง โครงสร้างที่ถูกฮาโลเจนทำให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ส่งเสริมให้นักวิจัยสำรวจกิจกรรมทางชีวภาพที่หลากหลาย