เมทอกซาตินโซเดียมซอลต์ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะโคแฟคเตอร์สำหรับเอนไซม์ โดยเฉพาะควิโนโปรตีน มีบทบาทสำคัญในปฏิกิริยาเรดอกซ์ สนับสนุนกระบวนการถ่ายโอนอิเล็กตรอนในเส้นทางเมแทบอลิซึมต่างๆ สารนี้จำเป็นในการศึกษาเมทานอลดีไฮโดรเจเนสของแบคทีเรีย ช่วยในการทำความเข้าใจเมแทบอลิซึมของจุลินทรีย์และการผลิตพลังงาน นอกจากนี้ ยังใช้ในเอ็นไซม์แอสเซย์เพื่อตรวจสอบกลไกของเอนไซม์ออกซิเดชัน สนับสนุนความก้าวหน้าในเอนไซมอลอจีและバイオเทคโนโลยี การประยุกต์ใช้นี้ยังขยายไปสู่การพัฒนาบิโอเซนเซอร์ ซึ่งเพิ่มความไวและความจำเพาะในการตรวจจับโมเลกุลชีวภาพ