6,7-Dichloroquinoxaline ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความสำคัญในหลายอุตสาหกรรม โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งใช้ในการผลิตยาต้านเชื้อแบคทีเรียและยาต้านเชื้อรา นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเพื่อพัฒนาสารกำจัดศัตรูพืชและสารป้องกันเชื้อรา เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่มีคลอรีนช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการออกฤทธิ์ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาการนำไปใช้ในอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์เพื่อพัฒนาวัสดุที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น สารกึ่งตัวนำและสารเรืองแสง