ใช้หลักๆ ในงานวิจัยเป็นตัวกลางทางเมแทบอลิซึมและมาตรฐานอ้างอิงในการทดสอบวิเคราะห์ ทำหน้าที่เป็นสารโมเดลสำหรับศึกษาการเมแทบอลิซึมของเมทิลแซนทีน โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับคาเฟอีนและอนุพันธ์ของมัน เนื่องจากมีความคล้ายคลึงทางโครงสร้างกับคาเฟอีน จึงบางครั้งใช้ในการศึกษาด้านเภสัชวิทยาเพื่อเข้าใจผลกระทบของแซนทีนที่ถูกเมทิลเลตต่อกิจกรรมของเอนไซม์และการจับกับตัวรับ โดยเฉพาะตัวรับอะดีโนซีน อาจใช้ในการพัฒนาและตรวจสอบวิธีการชีวาวิเคราะห์ เช่น HPLC หรือสเปกโตรเมตรีมวล สำหรับตรวจจับอนุพันธ์แซนทีนในตัวอย่างทางชีวภาพ