ยูโรโฟลลิโทรปินใช้หลักในการแพทย์ด้านการสืบพันธุ์เพื่อรักษาภาวะมีบุตรยาก โดยมักให้แก่ผู้หญิงที่มีปัญหาการตกไข่หรือการผลิตไข่ มักใช้เป็นส่วนหนึ่งของเทคโนโลยีช่วยการเจริญพันธุ์ เช่น การทำเด็กหลอดแก้ว (IVF) ฮอร์โมนนี้กระตุ้นให้รังไข่พัฒนาและสุกของฟอลลิเคิลหลายใบ เพิ่มโอกาสในการตกไข่และการตั้งครรภ์ที่สำเร็จ นอกจากนี้ยังใช้ในผู้ชายเพื่อกระตุ้นการผลิตอสุจิในกรณี hypogonadotropic hypogonadism ยูโรโฟลลิโทรปินมักใช้ร่วมกับยาความอุดมสมบูรณ์อื่นๆ เช่น human chorionic gonadotropin (hCG) เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพ การใช้ต้องมีการติดตามอย่างใกล้ชิดโดยบุคลากรทางการแพทย์เพื่อหลีกเลี่ยงภาวะแทรกซ้อน เช่น กลุ่มอาการกระตุ้นรังไข่เกิน (OHSS)