ยูโรโฟลลิโทรปินถูกใช้หลักในการรักษาภาวะมีบุตรยากเพื่อกระตุ้นการเจริญเติบโตของฟอลลิเคิลในรังไข่ของผู้หญิงที่มีปัญหาการตกไข่ มักใช้เป็นส่วนหนึ่งของเทคโนโลยีช่วยการเจริญพันธุ์ เช่น การปฏิสนธินอกร่างกาย (IVF) เพื่อส่งเสริมการพัฒนาฟอลลิเคิลหลายใบ เพิ่มโอกาสในการเก็บไข่สำเร็จ นอกจากนี้ ยังใช้ร่วมกับฮอร์โมนอื่น เช่น human chorionic gonadotropin (hCG) เพื่อกระตุ้นการตกไข่ ในผู้ชาย ยูโรโฟลลิโทรปินสามารถใช้รักษาภาวะ hypogonadotropic hypogonadism ซึ่งเป็นภาวะที่มีระดับเทสโทสเตอโรนต่ำ โดยกระตุ้นการสร้างสเปิร์ม การใช้ต้องได้รับการตรวจติดตามอย่างใกล้ชิดด้วยการตรวจฮอร์โมนและอัลตราซาวด์เพื่อให้มั่นใจในปริมาณที่เหมาะสมและลดความเสี่ยง เช่น กลุ่มอาการกระตุ้นรังไข่เกินขนาด (OHSS)