Rhodamine B isothiocyanate ใช้อย่างแพร่หลายในด้านชีววิทยาและเคมีวิเคราะห์ โดยเฉพาะในการติดฉลากสารชีวโมเลกุล เช่น โปรตีนและกรดนิวคลีอิก เพื่อใช้ในเทคนิคการตรวจสอบด้วยแสง เช่น กล้องจุลทรรศน์ฟลูออเรสเซนต์และโฟลว์ไซโตเมทรี เนื่องจากมีความสามารถในการเรืองแสงที่เข้มข้นและเสถียร ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ของโมเลกุลและการติดตามกระบวนการทางชีวภาพในเซลล์ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านชีวการแพทย์เพื่อระบุและติดตามเซลล์หรือโมเลกุลเป้าหมายในระบบชีวภาพ