Ribozinoindole-1 ใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมี โดยเฉพาะการศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และการเร่งปฏิกิริยาของ RNA โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ช่วยให้ทำหน้าที่เป็นตัวเลียนแบบหรือตัวยับยั้งในปฏิกิริยาเอนไซม์ ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการทำงานของ ribozymes และโมเลกุล RNA ที่มีฤทธิ์เร่งปฏิกิริยาอื่นๆ สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาใหม่ โดยเฉพาะในการกำหนดเป้าหมายโรคที่เกี่ยวข้องกับ RNA นอกจากนี้ ยังเป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในชีววิทยาสังเคราะห์สำหรับการออกแบบและปรับปรุง ribozymes ปรับแต่งที่มีคุณสมบัติเร่งปฏิกิริยาเฉพาะ การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การค้นพบยา ที่ช่วยในการระบุสารนำร่องที่อาจใช้รักษาความผิดปกติทางพันธุกรรมที่เชื่อมโยงกับการทำงานผิดปกติของ RNA