โซเดียมไฮโดรเจนฟอสเฟตไดไฮเดรต ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารบัฟเฟอร์ในงานชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุลต่างๆ ช่วยรักษาความเป็นกรด-ด่างให้คงที่ในสารละลาย ซึ่งสำคัญสำหรับปฏิกิริยาเอนไซม์ สื่อเพาะเลี้ยงเซลล์ และกระบวนการชำระล้างโปรตีน ในอุตสาหกรรมอาหาร ทำหน้าที่เป็นสารช่วยอิมัลชันและสารทำให้คงตัว โดยเฉพาะในชีสแปรรูปและผลิตภัณฑ์เนื้อสัตว์ เพื่อปรับปรุงเนื้อสัมผัสและอายุการเก็บรักษา ยังใช้ในการบำบัดน้ำเพื่อควบคุมความกระด้างของน้ำและป้องกันการเกิดตะกรันในหม้อต้มและท่อ ในเภสัชกรรม ใช้เป็นสารช่วยยาในเม็ดยาเพื่อควบคุมความเป็นกรดและเพิ่มความคงตัวของยา ในน้ำยาซักล้างและน้ำยาล้างจาน ทำหน้าที่เป็นสารปรับน้ำอ่อน เพิ่มประสิทธิภาพการทำความสะอาดโดยจับไอออนแคลเซียมและแมกนีเซียมในน้ำกระด้าง นอกจากนี้ ในด้านการเกษตร ใช้เป็นส่วนผสมในปุ๋ยเพื่อเสริมฟอสฟอรัสให้พืช