TPCK ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในงานวิจัยทางชีวเคมี โดยเฉพาะในการศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์โปรตีเอส เนื่องจาก TPCK สามารถยับยั้งกิจกรรมของเอนไซม์เหล่านี้ได้อย่างเฉพาะเจาะจง โดยการทำปฏิกิริยากับไซต์แอคทีฟของเอนไซม์ ทำให้มันเป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์ในการวิเคราะห์บทบาทของโปรตีเอสในกระบวนการทางชีววิทยาต่างๆ เช่น การย่อยโปรตีน การส่งสัญญาณภายในเซลล์ และการตายของเซลล์

นอกจากนี้ TPCK ยังถูกใช้ในการศึกษาการควบคุมการแสดงออกของยีน เนื่องจากโปรตีเอสมีส่วนเกี่ยวข้องในกระบวนการนี้ด้วย การใช้ TPCK ช่วยให้นักวิจัยสามารถระบุได้ว่าโปรตีเอสชนิดใดมีบทบาทสำคัญในกลไกการควบคุมดังกล่าว

ในการวิจัยเพื่อพัฒนายาใหม่ๆ TPCK ถูกนำมาใช้เป็นแบบจำลองในการออกแบบสารยับยั้งโปรตีเอสที่เกี่ยวข้องกับโรคต่างๆ เช่น โรคมะเร็ง โรคติดเชื้อ และโรคทางระบบประสาท การเข้าใจกลไกการยับยั้งของ TPCK ช่วยในการออกแบบสารยับยั้งที่มีประสิทธิภาพและมีความจำเพาะสูง

สุดท้าย TPCK ยังถูกใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อปกป้องตัวอย่างโปรตีนจากการย่อยสลาย โดยการยับยั้งโปรตีเอสที่อาจทำให้ตัวอย่างเสียหายระหว่างกระบวนการแยกหรือวิเคราะห์