3-(Trimethylsilyloxy)-1-butyne ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาเคมีที่เกี่ยวข้องกับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน (Carbon-Carbon Bond Formation) เช่น ปฏิกิริยา Sonogashira Coupling ซึ่งใช้ในการสร้างพันธะระหว่างกลุ่มอัลคีนกับอัลไคน์ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการป้องกันกลุ่มไฮดรอกซิล (Hydroxyl Protection) ในโมเลกุลอินทรีย์ โดยกลุ่ม Trimethylsilyloxy สามารถถอดออกได้ง่ายในขั้นตอนต่อมา สารนี้จึงมีความสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยา สารประกอบธรรมชาติ และวัสดุพิเศษ