โซเดียมไซยาเนตถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาสำหรับการผลิตสารประกอบอินทรีย์ต่างๆ มักใช้ในการสังเคราะห์อนุพันธ์ยูเรีย ซึ่งมีความสำคัญในการผลิตยา สารเคมีทางการเกษตร และพลาสติก ในอุตสาหกรรมยา มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาบางชนิด รวมถึงยาต้านชักและยาลดความดันโลหิต นอกจากนี้ โซเดียมไซยาเนตยังใช้ในการเตรียมสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งช่วยเพิ่มผลผลิตทางการเกษตรโดยการควบคุมประชากรของวัชพืชและศัตรูพืช มันยังพบการใช้งานในการผลิตสารเคมีพิเศษ เช่น สีย้อมและเม็ดสี โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลาง ในบางกรณี ถูกนำไปใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาเส้นทางสังเคราะห์ใหม่