CYM-5541 ใช้หลักๆ ในงานวิจัยเพื่อศึกษาและปรับการทำงานของตัวรับ S1P1 ซึ่งเป็นส่วนสำคัญในเส้นทางส่งสัญญาณ sphingosine-1-phosphate สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นตัวกระตุ้นแบบเลือกสรร (selective agonist) ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการศึกษาการควบคุมระบบภูมิคุ้มกัน โดยเฉพาะกระบวนการเช่น การเคลื่อนย้ายของเซลล์น้ำเหลือง (lymphocyte trafficking) และการทำงานของหลอดเลือด (vascular function) การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการศึกษาก่อนคลินิกที่มุ่งเน้นโรคภูมิต้านตนเอง (autoimmune diseases) การอักเสบ และมะเร็ง ซึ่งการปรับตัวรับ S1P1 มีความสนใจในด้านการรักษา นักวิจัยยังใช้ CYM-5541 เพื่อสำรวจศักยภาพในการควบคุมความสมบูรณ์ของกำแพงเซลล์บุหลอดเลือด (endothelial barrier integrity) ซึ่งเกี่ยวข้องกับภาวะเช่น ภาวะติดเชื้อในกระแสเลือด (sepsis) และการบาดเจ็บของปอดเฉียบพลัน (acute lung injury) ความจำเพาะและความแรงของมันทำให้เป็นสารประกอบที่สำคัญในการพัฒนาความเข้าใจในด้านภูมิคุ้มวิทยาและเภสัชวิทยา