MTSSL ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการติดฉลากสปินแบบกำหนดตำแหน่ง (SDSL) เพื่อศึกษากโครงสร้างและพลวัตของโปรตีนผ่านสเปกโทรสโกปีการเรโซแนนซ์พารามากเนติกอิเล็กตรอน (EPR) มันมีประสิทธิภาพโดยเฉพาะในการติดฉลากสปินกับสารตกค้างซิสเทอีนในโปรตีน ทำให้นักวิจัยสามารถตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงโครงสร้าง การโต้ตอบโปรตีน-โปรตีน และพลวัตของโปรตีนเมมเบรน การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการทำความเข้าใจกลไกการพับตัวของโปรตีนและผลกระทบของการกลายพันธุ์ต่อพฤติกรรมโปรตีน นอกจากนี้ MTSSL ยังถูกใช้ในการวัดระยะห่างโดยใช้เทคนิค EPR พัลส์ เช่น DEER (Double Electron-Electron Resonance) เพื่อทำแผนที่การจัดวางเชิงพื้นที่ในระบบชีวโมเลกุลที่ซับซ้อน ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าต่อการวิจัยชีววิทยาโครงสร้างและชีวฟิสิกส์