7-azaspiro[3.5]nonane ถูกใช้ในการพัฒนาสารประกอบเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างสไปโรไซคลิกที่ไม่เหมือนใครทำให้เป็นโครงสร้างพื้นฐานที่มีคุณค่าในเคมียารักษา ซึ่งมักถูกนำเข้าไปในยาตัวประกอบที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์และภาวะซึมเศร้า นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการสร้างลิแกนด์สำหรับการปรับเปลี่ยนตัวรับ ช่วยในการศึกษากลไกทางชีวภาพต่างๆ การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การวิจัยเคมีเกษตร ที่ซึ่งมันถูกสำรวจเพื่อพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ ความหลากหลายของสารประกอบในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีประโยชน์สำหรับการสร้างโครงสร้างเคมีที่ซับซ้อนในการวิจัยทางวิชาการและอุตสาหกรรม