SSEA-1-PrNH2 ถูกใช้หลักในการวิจัยและการประยุกต์ใช้ทางชีวการแพทย์ โดยเฉพาะในการศึกษาสเต็มเซลล์และการแยกตัวของเซลล์ (cellular differentiation) มันทำหน้าที่เป็นตัวบ่งชี้เฉพาะสำหรับการระบุและแยกเซลล์ต้นกำเนิดบางประเภท เช่น สเต็มเซลล์ตัวอ่อนและเซลล์สืบพันธุ์ เนื่องจากความสามารถในการจับกับแอนติเจนบนพื้นผิวเซลล์เฉพาะ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาการบำบัดแบบมุ่งเป้าและการวินิจฉัย ซึ่งคุณสมบัติการจับแบบเลือกสรรช่วยให้สามารถส่งยารักษาหรือสารตรวจภาพไปยังกลุ่มเซลล์เฉพาะได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ SSEA-1-PrNH2 ยังมีบทบาทในการทำความเข้าใจปฏิสัมพันธ์บนพื้นผิวเซลล์และเส้นทางการส่งสัญญาณ สนับสนุนความก้าวหน้าในการแพทย์ฟื้นฟูและการวิจัยมะเร็ง