SSEA-1-PrNH2 ถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางชีววิทยาและเวชศาสตร์ โดยเฉพาะในด้านการศึกษาสเต็มเซลล์และการพัฒนาวัคซีน เนื่องจากมันเป็นโมเลกุลที่เกี่ยวข้องกับการแสดงออกของแอนติเจนบนพื้นผิวเซลล์ ซึ่งช่วยในการระบุและแยกเซลล์ต้นกำเนิด (stem cells) ได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังมีบทบาทสำคัญในการศึกษากระบวนการทางภูมิคุ้มกันและการออกแบบวัคซีนที่มุ่งเป้าไปที่เซลล์มะเร็งหรือเซลล์ที่ติดเชื้อ โดยการนำ SSEA-1-PrNH2 มาใช้ในการสร้างแอนติบอดีหรือโมเลกุลเฉพาะทางที่สามารถจดจำและทำลายเซลล์เป้าหมายได้อย่างมีประสิทธิภาพ