ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างเป็นไซคลิก อะซีติดีน ซึ่งเป็นโครงสร้างสำคัญในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพหลายชนิด โดยหมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันไนโตรเจน ช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งที่ต้องการ ส่วนหมู่เมทอกซีที่ตำแหน่ง 3 ช่วยเพิ่มความเข้ากันได้ต่อตัวทำละลายและปรับสมบัติทางเคมีของโมเลกุล นิยมใช้ในงานพัฒนายา โดยเฉพาะในสารที่มีเป้าหมายเป็นเอนไซม์หรือตัวรับในร่างกาย ทั้งในด้านยาต้านมะเร็ง ยาทางระบบประสาท และยารักษาโรคติดเชื้อ