Trifluoromethylsulfinyl chloride ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นรีเอเจนต์ที่หลากหลายสำหรับการนำกลุ่ม trifluoromethylsulfinyl เข้าสู่โมเลกุลต่างๆ กลุ่มฟังก์ชันนี้มีคุณค่าต่อการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร เนื่องจากช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการย่อยสลายทางชีวภาพของสารประกอบ นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างฮีเทอโรไซเคิลที่มีซัลเฟอร์ ซึ่งสำคัญในเคมียารักษาโรคสำหรับการออกแบบยาที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ นอกจากนั้นยังเป็นสารตัวกลางหลักในการเตรียม trifluoromethyl sulfoxides ซึ่งใช้ในการสังเคราะห์แบบอะซิมเมトリกและการเร่งปฏิกิริยา ความตอบสนองของมันทำให้เป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์ในการปรับเปลี่ยนโมเลกุลที่ซับซ้อนสำหรับการวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม