ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างเฉพาะ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม ซึ่งทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้นหรือสารตัวกลางในการสร้างสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพ หรือสารยับยั้งเอนไซม์บางชนิด โครงสร้างไซโคลโพรเพลนช่วยเพิ่มเสถียรภาพของโมเลกุลและสามารถปรับปรุงการดูดซึมในร่างกายได้ จึงมีความน่าสนใจในการพัฒนายาใหม่ที่ต้องการความจำเพาะและประสิทธิภาพสูง