ใช้เป็นตัวกลางหลักในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร หมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์ทำปฏิกิริยากับอะมีนและแอลกอฮอล์ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างซัลโฟนามายด์และซัลโฟเนตเอสเทอร์ ซึ่งเป็นโครงสร้างสำคัญในการออกแบบยา ใช้บ่อยในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากสารแทนที่คลอโรและเมทอกซีช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสีย้อมและวัสดุฟังก์ชันนัลที่ต้องการอนุพันธ์ซัลโฟนิลอะโรมาติก ความสามารถในการทำปฏิกิริยาเอื้อต่อการดัดแปลงเลือก性ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน