ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฐานซัลโฟนาไมด์ซึ่งมีคุณสมบัติต้านจุลชีพและยับยั้งเอนไซม์ ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมีเภสัชกรรมในการสร้างสารประกอบที่เล็งเป้าไปที่เอนไซม์คาร์บอนิกอะนไฮเดรส ซึ่งเกี่ยวข้องกับการรักษาโรคต้อหิน โรคลมชัก และมะเร็งบางชนิด โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเลือกในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในยาที่เป็นผู้สมัคร นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับออกแบบโมเลกุลชีวภาพที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อม