ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมยาที่มีฐานซัลโฟนาไมด์ ทำหน้าที่เป็นสารทำให้เกิดซัลโฟนิลเรชัน ช่วยในการนำกลุ่ม 4-โบรโมเบนซีนซัลโฟนิลเข้าสู่อะมีนและนิวคลีโอไฟล์อื่นๆ การมีอะตอมโบรมีนช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปพลิง เช่น ซูซูกิหรือเฮ็ค ทำให้มีคุณค่าสำคัญในเคมียารักษาในการสร้างโมเลกุลซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายับยั้งโปรติเอสและสารชีวภาพอื่นๆ ที่กลุ่มซัลโฟนิลฟลูออไรด์ทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้งเอนไซม์ นอกจากนั้นยังใช้เป็นตัวตรวจสอบทางเคมีในการศึกษาโปรตีนและเอนไซม์ เนื่องจากสามารถทำปฏิกิริยากับหมู่ไซตีน เซรีน หรือไทโรซีนในโปรตีนได้อย่างจำเพาะ ความตอบสนองและความหลากหลายของมันสนับสนุนการใช้ในทั้งการสังเคราะห์แบบเฟสละลายและเฟสของแข็ง รวมถึงการวิจัยทางชีวเคมี