Methoxymethyl phenyl sulfone ใช้หลักๆ เป็นสารตัวกลางที่หลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร เป็นส่วนประกอบหลักในการสังเคราะห์สารประกอบออกฤทธิ์ต่างๆ รวมถึงยาต้านการอักเสบและยาต้านไวรัส โครงสร้างทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์ช่วยให้เข้าร่วมในปฏิกิริยาที่นำกลุ่มเมทอกซิเมทิลเข้าไป ซึ่งมีคุณค่าในการปรับเปลี่ยนคุณสมบัติของโมเลกุลเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารเคมีพิเศษ เช่น สีย้อมและโพลิเมอร์ โดยโมเลกุลส่วนซัลโฟนช่วยเพิ่มความเสถียรและปฏิกิริยา การนำไปใช้ในปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามยังทำให้มีประโยชน์ในการสร้างกรอบอินทรีย์ที่ซับซ้อนสำหรับวัสดุขั้นสูง