เมทิลฟีนิลซัลฟอกไซด์ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางในการผลิตยาและสารเคมีเกษตรต่างๆ มันทำหน้าที่เป็นสารช่วยชิรัลในสังเคราะห์แบบอะซิมเมตริก ซึ่งช่วยในการสร้างสารประกอบที่มีเอ็นแอนติโอเมอร์บริสุทธิ์ ซึ่งมีความสำคัญในพัฒนายา นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์ซัลฟอกไซด์และซัลโฟน ซึ่งสำคัญในการผลิตโพลิเมอร์และสารเคมีพิเศษ บทบาทของมันในฐานะตัวทำละลายหรือตัวเร่งปฏิกิริยาในปฏิกิริยาเคมีบางชนิดยังทำให้มีคุณค่าในงานวิจัยและกระบวนการอุตสาหกรรม