Temoporfin ใช้ในการรักษาโรคมะเร็งผิวหนังชนิดเบซัลเซลล์คาร์ซิโนมา (Basal Cell Carcinoma) โดยเฉพาะเมื่อไม่สามารถรักษาด้วยการผ่าตัดได้ วิธีการรักษานี้เรียกว่า Photodynamic Therapy (PDT) ซึ่งใช้ Temoporfin ร่วมกับแสงเลเซอร์เพื่อทำลายเซลล์มะเร็ง โดย Temoporfin จะถูกฉีดเข้าสู่ร่างกายและสะสมในเซลล์มะเร็ง จากนั้นใช้แสงเลเซอร์กระตุ้นให้เกิดปฏิกิริยาเคมีที่ทำลายเซลล์มะเร็งโดยไม่ทำลายเนื้อเยื่อปกติรอบข้าง นอกจากนี้ยังใช้ในการรักษามะเร็งศีรษะและคอในบางกรณี การรักษาด้วยวิธีนี้มีข้อดีคือลดผลข้างเคียงและฟื้นตัวเร็วเมื่อเทียบกับการรักษาด้วยวิธีอื่น