เมทิลเตตราซีน-โพรพิลามีนถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านเคมีชีวภาพและเทคโนโลยีชีวภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการติดฉลากโมเลกุลและการเชื่อมโยงโมเลกุลด้วยปฏิกิริยาไบโอออร์โทโกนัล เนื่องจากมีความสามารถในการเกิดปฏิกิริยาแบบผกผันอิเล็กตรอนดีนส์ (inverse electron demand Diels-Alder) กับไดอีนอย่างรวดเร็วและมีความจำเพาะสูง ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพในการติดฉลากโปรตีน, ดีเอ็นเอ, และเซลล์สำหรับการศึกษาต่างๆ เช่น การติดตามการเคลื่อนที่ของเซลล์, การถ่ายภาพโมเลกุล, และการวินิจฉัยโรค นอกจากนี้ยังมีการใช้ในด้านนาโนเทคโนโลยีเพื่อการประกอบโครงสร้างนาโนและระบบส่งส่งยาที่แม่นยำ