ใช้เป็นตัวกลางหลักในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะสารกำจัดแมลงในกลุ่มนีโอไนโคตินอยด์ เช่น ไธอาเมทอกซัม (thiamethoxam) ซึ่งมีฤทธิ์กำจัดศัตรูพืช เช่น เพลี้ย, แมลงดูดน้ำเลี้ยง, และแมลงเจาะลำต้น เนื่องจากโครงสร้างที่ตอบสนองได้ดีและสามารถสร้างพันธะที่มั่นคงกับหมู่ฟังก์ชันอื่นๆ

กลุ่มคลอโรเมทิลช่วยให้เกิดการแทนที่ได้ง่าย จึงมีคุณค่าในการสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน ใช้อย่างแพร่หลายในการพัฒนาสารป้องกันพืชสำหรับควบคุมแมลง

นอกจากนี้ ในเภสัชเคมี ยังนำมาใช้ในการสร้างยาตัวยับยั้งจากโครงสร้างไทอะโซลที่มีคุณสมบัติต้านจุลชีพหรือต้านการอักเสบ