4-Chlorothiazol-2-amine ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตรต่างๆ โครงสร้างที่มีวงแหวนไทอะซอลคลอรีนและกลุ่มอะมีน ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ ในอุตสาหกรรมยา มักใช้ในการพัฒนายารักษาโรคติดเชื้อ เนื่องจากอนุพันธ์ไทอะซอลมีคุณสมบัติต้านจุลชีพและต้านเชื้อรา นอกจากนี้ ยังเป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งโครงสร้างทางเคมีช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการควบคุมการเจริญเติบโตของพืชที่ไม่ต้องการและศัตรูพืช ความตอบสนองของสารยังช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติม สร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้นสำหรับการวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม