ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชภัณฑ์ที่อิงจาก thienopyrimidine โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการบำบัดมะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์สำหรับการปรับปรุงประสิทธิภาพยาและการดูดซึมทางชีวภาพ ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยเพื่อออกแบบอนุพันธ์ที่มุ่งเป้าไปยังตัวรับ epidermal growth factor (EGFR) และ tyrosine kinases อื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับการลุกลามของเนื้องอก นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพซึ่งมีคุณสมบัติต้านไวรัสและต้านการอักเสบ