แผ่นซิลิก้าเจลใช้ในการวิเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในเทคนิคโครมาโตกราฟีแบบชั้นบาง (Thin Layer Chromatography หรือ TLC) ซึ่งเป็นวิธีที่นิยมในการแยกและวิเคราะห์สารเคมีต่างๆ เช่น ยา สารประกอบอินทรีย์ หรือสารชีวโมเลกุล เนื่องจากแผ่นซิลิก้าเจลมีคุณสมบัติในการดูดซับที่ดี ช่วยให้สามารถแยกสารได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการตรวจสอบความบริสุทธิ์ของสาร ระบุสารต่างๆ และติดตามปฏิกิริยาเคมีในห้องปฏิบัติการ