แผ่นซิลิกาเจลใช้ในการวิเคราะห์สารเคมีด้วยเทคนิคโครมาโตกราฟีแบบชั้นบาง (TLC) ซึ่งเป็นวิธีที่นิยมในห้องปฏิบัติการเพื่อแยกและระบุสารประกอบต่างๆ ในตัวอย่าง แผ่นซิลิกาเจลทำหน้าที่เป็นเฟสคงที่ ที่ช่วยในการแยกสารตามความสามารถในการดูดซับและความแตกต่างของความเร็วในการเคลื่อนที่ของสารแต่ละชนิดเมื่อใช้ตัวทำละลายเป็นเฟสเคลื่อนที่ นอกจากนี้ยังใช้ในการตรวจสอบความบริสุทธิ์ของสาร ติดตามปฏิกิริยาเคมี และวิเคราะห์สารธรรมชาติ เช่น พืช สมุนไพร และสารสกัดจากธรรมชาติ แผ่นซิลิกาเจลยังมีบทบาทสำคัญในกระบวนการวิจัยและพัฒนายา เพื่อวิเคราะห์ส่วนประกอบและความเข้มข้นของสารออกฤทธิ์ในผลิตภัณฑ์ยา