ใช้เป็นรีเอเจนต์ในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบเฮเตโรไซคลิก ทำหน้าที่เป็นสารไทโอไซยาเนตสำหรับคีโตนหอมและมีส่วนร่วมในปฏิกิริยาการสร้างวงแหวนเพื่อก่อตัวเฮเตโรไซคลิกที่มีกำมะถันและมีฤทธิ์ทางชีวภาพ นิยมใช้ในเคมีเภสัชกรรมเพื่อดัดแปลงโครงสร้างโมเลกุลให้มีคุณสมบัติทางเภสัชวิทยาดีขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารกลางสำหรับยาและสารเคมีเกษตรเนื่องจากความตอบสนองกับนิวคลีโอไฟล์ แสดงประโยชน์ในงานวิจัยสำหรับตรวจสอบกลไกปฏิกิริยาที่เกี่ยวข้องกับการถ่ายโอนไทโอไซยาเนต