1,3-Propanedithiol ใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างพันธะไดซัลไฟด์ ซึ่งมีความสำคัญในด้านชีวเคมีและเภสัชวิทยา นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารประกอบอินทรีย์ที่มีกำมะถัน เช่น thioesters และ thioethers ซึ่งมีบทบาทในอุตสาหกรรมเคมีและวัสดุศาสตร์ ในด้านนาโนเทคโนโลยี 1,3-Propanedithiol ถูกนำมาใช้เป็นสารเคลือบพื้นผิวเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติของวัสดุนาโน เช่น อนุภาคทองคำหรือควอนตัมดอท ทำให้สามารถควบคุมการกระจายตัวและความเสถียรของอนุภาคได้ดีขึ้น นอกจากนี้ยังมีการใช้ในกระบวนการปรับแต่งพื้นผิวของเซนเซอร์หรืออุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการตรวจจับสารเคมีหรือชีวโมเลกุลเฉพาะเจาะจง