ใช้เป็นสารตัวกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นรูปแบบป้องกันของ thiomorpholine ซึ่งช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกที่ได้ที่ตำแหน่งฟังก์ชันอื่นๆ ในการประกอบโมเลกุลซับซ้อน ใช้บ่อยในเคมียารักษาเพื่อสร้างฮีเทอโรไซเคิลที่มีธาตุกำมะถันซึ่งมีศักยภาพทางชีวภาพ กลุ่มเอสเตอร์ tert-butyl ช่วยให้สามารถถอดกลุ่มป้องกันได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์หลายขั้นตอนของยาตัวสมัคร นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารยับยั้งโปรติเอสและสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพอื่นๆ ที่ต้องการโครงสร้าง thiomorpholine