2-Thiothinone hydrochloride ถูกนำมาใช้ในวงการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษาคุณสมบัติทางเคมีและชีวภาพ โดยเฉพาะในด้านเภสัชวิทยาและเคมีอินทรีย์ มันอาจถูกใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบอื่น ๆ ที่มีศักยภาพในการพัฒนายา นอกจากนี้ ยังสามารถนำไปใช้ในการวิจัยเกี่ยวกับปฏิกิริยาเคมีและกลไกการทำงานของโมเลกุลต่าง ๆ ในร่างกาย ซึ่งช่วยในการพัฒนาความเข้าใจเกี่ยวกับกระบวนการทางชีวเคมีและโรคต่าง ๆ