ใช้ในสังเคราะห์สารอินทรีย์เป็นสารตั้งต้นในการผลิตยาหรือสารชีวภาพที่มีโครงสร้างเบนโซ[b]ไทโอเฟน-2-คาร์บอกซิเลต โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาท ยาลดความดันโลหิต หรือยาต้านการอักเสบ โครงสร้างที่มีหมู่คลอโรที่ตำแหน่ง 3 และโบรมที่ตำแหน่ง 4 มีผลต่อการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ ทำให้มีศักยภาพในการปรับเปลี่ยนคุณสมบัติของสารออกฤทธิ์ โครงสร้างแกนเบนโซไทโอเฟนสนับสนุนการสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกซับซ้อนที่พบในโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีเภสัชกรรมสำหรับการดัดแปลงเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกเฉพาะของยา นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวกลางที่หลากหลายในปฏิกิริยาเคมีเพื่อสร้างสารอนุพันธ์ที่ซับซ้อนมากขึ้นในห้องปฏิบัติการวิจัย และนำไปใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและเป็นมิตรต่อสิ่งแวดล้อม