ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ที่ต้องการวงแหวนไทโอฟีนที่ถูกปรับแต่ง กลุ่มโบรมีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม สร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในการผลิตยาฆ่าแมลง ยาฆ่าหญ้า และยารักษาบางชนิด เนื่องจากแกนไทโอฟีนให้ความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสร้างโพลิเมอร์นำไฟฟ้าและเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ ใช้ในสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตสารประกอบที่มีโครงสร้างไทโอฟีน ซึ่งมักเป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็ง ยาต้านจุลชีพ และสารกำจัดศัตรูพืช นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยาในกระบวนการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนผ่านปฏิกิริยาเชิงพาณิชย์ เช่น การทำปฏิกิริยากับสารประกอบออร์แกโนเมทัลลิก เพื่อสร้างอนุพันธ์ที่ซับซ้อนยิ่งขึ้นสำหรับงานวิจัยและพัฒนายา