ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้าและยารักษาโรคจิต โครงสร้างของสารประกอบนี้ซึ่งมีหมู่อะมีนและหมู่บรอมมีนบนวงแหวนไทโอฟีน ช่วยให้สามารถปรับแต่งได้ง่ายผ่านปฏิกิริยาต่างๆ เช่น การแทนที่นิวคลีโอไฟล์หรือการเชื่อมต่อแบบพัลลาเดียมคาเทลิสต์ ทำให้เป็นตัวตั้งต้น (building block) ที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ มักใช้ในการเตรียมตัวปรับสัญญาณรับเซโรโทนินและโดพามีน นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับการผลิตยาฆ่าแมลงบางชนิด เนื่องจากช่วยเพิ่มความสามารถในการจับคู่กับสารออกฤทธิ์ และมักใช้ในงานวิจัยเพื่อพัฒนาสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษา