2-Iodo-3-methylthiophene ถูกใช้หลัก ๆ ในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาและสารเคมีทางการเกษตรต่าง ๆ มันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาสารประกอบที่基于 thiophene ซึ่งเป็นที่รู้จักในด้านกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการสร้างวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ เช่น โพลิเมอร์นำไฟฟ้าและเซมิคอนดักเตอร์ เนื่องจากโครงสร้าง thiophene ของมัน ผู้แทนไอโอดีนยังทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีประโยชน์ในการทำปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนได้ โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกซึ่งเป็นโครงสร้างพื้นฐานที่สำคัญในอุตสาหกรรมยาและสารเคมีทางการเกษตร และใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบไอโอดีนที่ซับซ้อนมากขึ้นสำหรับการพัฒนายาใหม่ ๆ หรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ รวมถึงงานวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและการเกิดพันธะเคมีต่าง ๆ