ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายากลุ่ม modulator ของตัวรับนิโคตินิกและยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ ใช้กันทั่วไปในเคมีเภสัชกรรมสำหรับการสร้างยาที่มีฐานไพรีดีน นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับพัฒนาสารกำจัดศัตรูพืชชนิดใหม่ที่มีการออกฤทธิ์แบบเฉพาะเจาะจง กลุ่ม chloromethyl ช่วยให้สามารถติดต่อกับส่วนย่อยอื่นๆ ได้ง่าย เพิ่มประสิทธิภาพในการใช้เคมีแบบคอมบิเนตอเรียลและการสังเคราะห์ไลบรารี