ใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชวิทยาเป็นหลัก โดยเฉพาะในการศึกษาเกี่ยวกับฮอร์โมนเพศหญิง เนื่องจากเฟรูทินินมีฤทธิ์คล้ายเอสโตรเจน ทำให้สามารถนำมาใช้ในการศึกษาผลกระทบของสารที่เลียนแบบฮอร์โมนในร่างกาย เช่น การทำงานของตัวรับเอสโตรเจน การเจริญเติบโตของเซลล์ และกลไกการควบคุมทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับระบบสืบพันธุ์ นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการพัฒนายาที่เกี่ยวข้องกับภาวะขาดฮอร์โมนเอสโตรเจน เช่น อาการวัยทอง หรือโรคกระดูกพรุน เนื่องจากมีศักยภาพในการช่วยเสริมสร้างกระดูกและลดการสูญเสียมวลกระดูกในแบบจำลองสัตว์ทดลอง อย่างไรก็ตาม การใช้เฟรูทินินยังอยู่ในขั้นตอนการวิจัย และยังไม่ได้รับการอนุมัติให้ใช้ในทางคลินิก เนื่องจากต้องมีการศึกษาเพิ่มเติมเกี่ยวกับความปลอดภัยและผลข้างเคียงในระยะยาว