ฟอลินิค แอซิด ใช้ในทางการแพทย์เพื่อลดผลข้างเคียงจากยาเมโธเทรกเสต โดยเฉพาะในผู้ป่วยที่ได้รับเมโธเทรกเสตในขนาดสูง เช่น ในการรักษาโรคมะเร็ง ฟอลินิค แอซิดช่วยฟื้นฟูการทำงานของเซลล์ปกติ โดยเฉพาะในไขกระดูกและเยื่อบุทางเดินอาหาร ทำให้ลดความเสี่ยงของการเกิดภาวะเม็ดเลือดต่ำ หรือแผลในช่องปาก นอกจากนี้ ยังใช้ร่วมกับยา 5-ฟลูออโรยูราซิล (5-FU) ในการรักษาโรคมะเร็งลำไส้ใหญ่และทวารหนัก เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของยา 5-FU ในการทำลายเซลล์มะเร็ง ในบางกรณี ฟอลินิค แอซิดอาจใช้ในการรักษาภาวะขาดวิตามินบี12 หรือภาวะเมตาบอลิซึมผิดปกติที่เกี่ยวข้องกับการใช้กรดโฟลิกในร่างกาย โดยเฉพาะในผู้ป่วยที่มีความผิดปกติของการดูดซึมหรือการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่ส่งผลต่อการใช้โฟเลต