ใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยาในสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตสารกำจัดศัตรูพืชและยาบางชนิด เนื่องจากหมู่อะซิลคลอไรด์มีความไวในการทำปฏิกิริยากับสารประกอบที่มีหมู่ -OH หรือ -NH2 ได้ง่าย ทำให้สามารถนำไปต่อเติมเป็นเอสเทอร์หรือแอมไลด์ได้ ซึ่งโครงสร้างที่มีฟลูออรีนและไตรฟลูออร์เมทิลช่วยเพิ่มความสามารถในการซึมผ่านของเซลล์และเสถียรภาพของโมเลกุลในระบบชีวภาพ จึงนิยมใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะสูง