ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีความสำคัญต่ออุตสาหกรรมยา โดยเฉพาะในการผลิตสารที่มีโครงสร้างพื้นฐานเป็นพิริมิดีน ซึ่งมักพบในยาต้านไวรัส ยารักษามะเร็ง และยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาท สารนี้ทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้น (building block) ในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยฟลูออรีนที่ตำแหน่ง 5 ช่วยเพิ่มความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ และปรับปรุงเสถียรภาพของโมเลกุล ส่งผลให้สารที่ได้มีฤทธิ์ทางชีวภาพสูงขึ้นและดูดซึมได้ดีในร่างกาย