ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง และสารต้านจุลชีพ บางครั้งนำไปใช้พัฒนายาต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ และเพิ่มความคงตัวของโมเลกุลในร่างกาย นอกจากนี้ยังใช้เป็นมาตราฐานอ้างอิงหรือตัวทำละลายในห้องปฏิบัติการวิเคราะห์สารเคมีเฉพาะทาง