ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยทำหน้าที่เป็นหน่วยสร้าง (building block) ที่มีหมู่ฟังก์ชันเฉพาะตัว ซึ่งช่วยให้สามารถเพิ่มกรดอะมิโนที่มีโครงสร้างพิเศษลงในสายเปปไทด์ได้ หมู่ Fmoc ทำหน้าที่ป้องกันหมู่อะมิโนในระหว่างการสังเคราะห์ และสามารถถอดออกได้ง่ายด้วยสารละลายเบสอ่อน เช่น แพนิลีน (piperidine) ทำให้เหมาะสมกับการสังเคราะห์แบบขั้นตอน โครงสร้างที่มีวงเบนซีนช่วยเพิ่มความเป็นไฮโดรโฟบิก ซึ่งมีประโยชน์ในการออกแบบเปปไทด์ที่ต้องการความสามารถในการผ่านเยื่อหุ้มเซลล์หรือการจับกับเป้าหมายเฉพาะในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชกรรม