ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุลและเภสัชกรรม เนื่องจากกลุ่ม Fmoc ทำหน้าที่เป็นตัวป้องกันหมู่อะมิโน ซึ่งสามารถถอดออกได้ภายใต้สภาวะเบสอ่อน โดยไม่ทำลายพันธะเปปไทด์หรือหมู่ฟังก์ชันอื่น ๆ โครงสร้างของ 3VVD ช่วยเลียนแบบลำดับกรดอะมิโนที่พบในโปรตีนธรรมชาติ ทำให้เหมาะสมสำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น เปปไทด์ที่ใช้ในการพัฒนาวัคซีนหรือสารยับยั้งเอนไซม์ นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อศึกษาโครงสร้าง-กิจกรรมของเปปไทด์ และพัฒนาโมเลกุลใหม่สำหรับการรักษาโรค