ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ต้องการความบริสุทธิ์สูง เนื่องจากหมู่ Fmoc ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ซึ่งสามารถถอดออกได้ภายใต้สภาวะเบสอ่อน โดยไม่ทำลายพันธะเปปไทด์หรือหมู่ฟังก์ชันอื่น ๆ โครงสร้างที่มีวงแหวนอะโรมาติกพร้อมหมู่เมธอกซีช่วยเพิ่มความละลายในตัวทำละลายอินทรีย์ และสามารถใช้เป็นหน่วยเชื่อมต่อในโมเลกุลที่ต้องการคุณสมบัติเฉพาะ เช่น ความเสถียรต่อเอนไซม์ หรือการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ นิยมใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมและชีววิทยาโมเลกุล