ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบขั้นตอนเดียว (solid-phase peptide synthesis) เนื่องจากกลุ่ม Fmoc ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ซึ่งสามารถถอดออกได้ภายใต้สภาวะเบสอ่อน โดยไม่ทำลายพันธะเปปไทด์หรือหมู่ป้องกันอื่นๆ ที่ไวต่อกรด ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีความซับซ้อน กรดอะมิโนอนุพันธ์นี้มีหมู่ไซด์เชนที่มีความยาวและมีหมู่คาร์บอกซิลิก ซึ่งสามารถใช้ในการเชื่อมต่อหรือต่อเติมโครงสร้าง เช่น การสร้างไซโคลิกเปปไทด์ การติดตั้งตัวติดตาม หรือการยึดเปปไทด์กับพื้นผิวของวัสดุ การมีหมู่ -COOH อิสระบนไซด์เชนช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาต่อไปได้ เช่น การสร้างอะไมด์หรือเอสเทอร์ จึงมีประโยชน์ในการออกแบบโมเลกุลเชิงชีวภาพและการพัฒนายา